Theo Bộ Công an, quá trình điều tra vụ án xảy ra tại Công ty Cổ phần Tập đoàn Yên Khánh, Tổng Công ty Cửu Long và các đơn vị có liên quan trong việc đấu giá và thu phí tuyến cao tốc TPHCM - Trung Lương, Cơ quan CSĐT Bộ Công an đã ra quyết định khởi tố bị can, tạm  giam ông Đinh La Thăng (hiện đang chấp hành án phạt tù trong vụ án khác) cùng 3 bị can về tội “Vi phạm quy định về sử dụng tài sản nhà nước gây thất thoát lãng phí”, theo Điều 219 Bộ luật Hình sự 2015.

Ba bị can còn lại, gồm: Ông Nguyễn Hồng Trường, cựu Thứ trưởng Bộ GTVT kiêm Chủ tịch Hội đồng bán đấu giá quyền thu phí cao tốc TPHCM - Trung Lương; Nguyễn Chí Thành, nguyên Vụ phó Vụ Tài chính Bộ GTVT, Ủy viên hội đồng bán đấu giá và Lê Trung Cường, Chuyên viên Vụ Tài chính Bộ GTVT, thành viên Tổ Thường trực giúp việc hội đồng bán đấu giá.

Cụ thể, tài sản thứ nhất là 2.198.000 cổ phần tại CTCP Cảng tân cảng Hiệp Phước. Cảng tân cảng Hiệp Phước là thành viên thuộc Tổng Công ty Tân Cảng Sài Gòn, trụ sở công ty tại Lô A9, khu A, Khu công nghiệp Hiệp Phước, xã Long Thới, huyện Nhà Bè, TP Hồ Chí Minh.