Sự khác lạ trong kiến trúc của chùa thể hiện ngay từ cánh cổng. Công trình này không có dạng tam quan thường thấy mà được thiết kế với 13 tầng mái chồng lên nhau...
Chùa Huyền Không được xây dựng trên nền những hốc đá tự nhiên dọc theo đường viền của mỏm núi, gồm hơn 40 gian phòng được thông với nhau bằng các hành lang, cầu và lối đi có lót ván.
Ngoài hệ thống cung điện, lăng tẩm đậm nét kiến trúc truyền thống, Cố đô Huế còn được du khách xa gần biết đến với những công trình kiến trúc tôn giáo độc đáo, có "1-0-2" Việt Nam.
(Kiến Thức) - Tháp Phước Duyên của chùa Thiên Mụ, tháp Đại Giác của chùa Huyền Không, tháp Miến Điện của chùa Thiền Lâm... là những tòa bảo tháp Phật giáo ấn tượng mà du khách phải ghé thăm ở Cố đô Huế.