Bên cạnh những lợi ích rõ ràng, ứng dụng khẩu trang điện tử Bluezone vẫn còn khiến nhiều người đặt nghi vấn về khả năng bảo mật thông tin. Đại diện Bộ Thông tin và Truyền thông đã chính thức lên tiếng về vấn đề này.